Replikationsgaflen
Topoisomeraser
DNA Pol III
DNA Damage
DNA Repair
100
Hvad er forskellen på leading strand og lagging strand?
Leading strand syntetiseres sammenhængende af DNA Pol III i 5' -> 3'-retning. Lagging strand syntetiseres i Okazaki-fragmenter af DNA Pol III i overordnet 3' -> 5'-retning, som sættes sammen af DNA Pol I og DNA Ligase.
100
Hvilken af de to typer Topoisomeraser bruger ATP?
Type II Topoisomeraser.
100
Er en __-afhængig __-polymerase
DNA-afhængig DNA-polymerase.
100
Nævn en sygdom der skyldes beskadiget DNA.
Fx. kræft.
100
Hvad hedder det G-rige stykke DNA som modvirker forkortning af eukaryot DNA?
Telomer.
200
Hvad betyder processivtiet, og hvilken subunit i DNA Pol III sørger for dennes processivetiet?
Enzymet forbliver bundet til dets substrat indtil hele reaktion er katalyseret. Sliding DNA Clamp (beta-subunit) sørger for DNA Pol III's processivetiet.
200
Hvad er DNA Gyrase?
Type II Topoisomerase i E.Coli.
200
Hvad er den eukaryote pendant til DNA Pol III?
DNA Pol Delta.
200
"Man lærer bedst hvis man er aktiv": 10 armbøjninger el. englehop = 200 point.
Stærkt lavet!
200
Telomerasen er en __-afhængig __-polymerase.
RNA-afhængig DNA-polymerase.
300
Hvad er henholdsvis "DnaB" og "SSB"?
DnaB = helicasen i replikationsgaflen. SSB = Single-Stranded-Binding protein, som holder den åbnede DNA-streng enkeltstrenget.
300
Beskriv kort funktionen af Type II Topoisomerase ved DNA replikation.
Topoisomerasen danner negativ supercoiling foran replikationsgaflen for at modvirke den positive supercoiling helicasen laver.
300
Hvilket instrument (på dansk) har givet navn til den "slide" lagging strand laver under replikationen. (__-slide)
Trækbasun (trombone-slide).
300
Hvad er konsekvenserne af strand breaks?
Polymeraserne falder af/stopper op.
300
Hvilket cytochrom står for afgiftning af kroppen.
Cytochrom P450.
400
Nævn de komponenter man finder mellem "Origin of Replication" og replikationsgaflen.
"Gammelt" DNA. Nysyntetesiret DNA (sammenhængende DNA og okazaki-fragmenter). DNA Pol III. DNA Pol I. SSB. Primere. DNA Ligase.
400
Hvilken aminosyre har katalytisk funktion i begge typer topoisomerase?
Tyrosin.
400
Hvad består den centrale struktur af?
Clamp-loader komplekset (1 gamma, 2 tau, 2 delta). DnaB. Chi og phi (interagerer med SSB).
400
Hvilken base parrer 8-oxoguanin med?
Adenin.
400
Hvordan repareres thymin-dimere?
Vha. DNA Photolyase.
500
Beskriv helicasens struktur.
Helicasen er en dimer bestående af 3 subunits hver. De 6 subunits er arrangeret i en ring, hvor DNA-strengen kan løbe igennem. Hver subunit har 3 loops der peger ind i helicasens center, hvoraf det ene (P-loop) kan binde ATP, og de to andre interagerer med DNA-strengen.
500
Beskriv strukturen af Type I og Type II topoisomerase.
Type I består af fire domæner arrangeret i en ring med en diameter på 20 Å. Type II består af en dimer med en stor kavitet.
500
Hvad består hver "polymerase core" af?
En alpha-subunit (polymeraseaktivitet). En epsilon-subunit (3'-5' exonuclease). En theta-subunit (ukendt funktion). En beta-dimer (sliding clamp).
500
Hvilken skade tilfører UV-lys DNA?
Tilstødende thymin-baser danner kovalente bindinger til hinanden, så replikation og transkription blokeres.
500
Hvad er NHEJ?
Nonhomolous end joining. KU binder sig til enderne af DNA'et og hjælper dem sammen, hvorefter en helicase gør de to ender enkeltstrengede, så de kan danne Wattson-Crick basepar.
M
e
n
u