Transcriptómica
Conjunto de diferentes RNA's de una célula obtenidos en una situación específica, derivados de transcripción.
¿Qué es el transcriptoma?
Primer método de estudio en transcriptómica, donde el RNA proveniente de una muestra es separado por electroforesis y luego transferido a una membrana para su reconocimiento.
¿Qué es el Northern-Blot?
Consiste en todas las proteínas que un organismo potencialmente puede expresar.
¿Qué es el proteoma?
Técnica de identificación de proteínas, donde primero se separan las proteínas por electroforesis y luego se transfieren a una membrana de nitrocelulosa, para su posterior análisis.
¿Qué es el Western-Blot?
Primer técnica de secuenciación, donde se usan terminadores (ddNTP's) de PCR, generando múltiples fragmentos que se separan por electroforesis para obtener la secuencia.
¿Qué es la secuenciación de Sanger?
Tipo de RNA que forma parte de las subunidades del spliceosoma, el cual se encarga en eliminar los intrones en la maduración de un RNAm eucariote.
¿Qué es el snRNA?
Técnica más avanzada de análisis en transcriptómica, que se caracteriza por secuenciar el RNA de una célula y el uso de software especializado.
¿Qué es el RNAseq?
Parte o región en el plegado de una proteína que tiene una función específica para la misma.
¿Qué es un dominio?
Electroforesis donde la proteína se expone a un agente desnaturalizante que cambia su carga a negativa para facilitar su separación en el gel de poliacrilamida.
¿Qué es la SDS-PAGE?
Tipo de RNA que no sufre modificaciones postranscripcionales (especificar tipo de célula).
¿Qué es el RNAm procariote?
Es una aplicación de la secuenciación del transcriptoma.
¿Qué es el descubrimiento de RNA no codificantes/comparación de nivel de expresión entre 2 células/descubrimiento de nuevos genes/identificación de diferencias entre 2 secuencias?
Tipo de secuenciación donde se amplifican fragmentos de PCR en un soporte sólido, generando clusters de fragmentos, los cuales son secuenciados al mismo tiempo.
¿Qué es la secuenciación de segunda generación (Illumina)?
Tipo de proteómica donde se usan técnicas de espectroscopía de resonancia magnética o cristalografía de rayos X, para establecer cómo está constituida la proteína y su complejidad.
¿Qué es la proteómica estructural?
¿Qué es la electroforesis 2D (en 2 dimensiones)?
Tipo de biblioteca en el que se aisla RNA, se retrotranscribe y luego se clona en bacterias, para su posterior análisis.
¿Qué es una biblioteca de cDNA?
Tipo de RNA que participa en el silenciamiento de material genético exógeno, probablemente durante un proceso de infección a la célula.
¿Qué es el siRNA?
Método utilizado en la secuenciación de genomas, donde el DNA es fragmentado en pequeñas piezas y se construye una biblioteca genómica (bacterias). La secuencia del genoma se reconstruye in silico.
¿Qué es la secuenciación escopeta (shotgun)?
Son aquellas proteínas homólogas que provienen de genes codificantes que se han duplicado a través de la evolución.
¿Qué son las proteínas parálogas?
Tipo de gel usado en electroforesis de proteínas donde una fracción se usa para concentrar todas las proteínas y la otra fracción para separarlas lentamente, lo que mejora su resolución.
¿Qué es un gel discontinuo?
Conjunto de técnicas usadas para separar (y purificar proteínas) ya sea por su tamaño, su interacción con algún ligando o variando el pH y buffer.
¿Qué son las técnicas de cromatografía?
Enzima utilizada en transcriptómica, indispensable porque el RNA de una célula debe convertirse en DNA primero para su posterior análisis.
¿Qué es la retrotranscriptasa?
Suponiendo que se compara 1 gen proveniente de dos células (una de referencia y otra "estresada"), es la razón que en el pozo de microarreglos se observe un color amarillo.
¿Qué es la expresión equitativa del gen en ambas células?
Es la modificación postranscripcional en eucariotas, que provoca que existan más de 100,000 proteínas en la célula, considerando que hay 20,000 genes codificantes.
¿Qué es el splicing alternativo?
Tipo de molécula que se usa para marcar, identificar o seleccionar proteínas en técnicas como ELISA o microarreglos de proteínas.
¿Qué es un anticuerpo?
Proceso evolutivo hipotético, en el cual se cree que muchas proteínas evolucionaron de dominios preexistentes.
¿Qué es el domain shuffling (entrecruzamiento de dominios)?