Transcripción en Eucariotas
¿Qué RNA polimerasa transcribe los genes eucariotas que codifican proteínas?
RNA polimerasa II.
¿Cómo se llama la modificación que se incorpora al extremo 5′ del mRNA eucariota?
Cap o caperuza 5′, que contiene una guanosina metilada.
¿Qué complejo celular realiza la síntesis de proteínas a partir del mRNA?
El ribosoma.
¿Cómo se llama la secuencia de DNA a la que se une un represor para controlar un operón?
Operador
¿Qué es un enhancer y necesita encontrarse inmediatamente junto al promotor?
Es una secuencia reguladora de DNA que favorece la transcripción. Puede actuar desde posiciones distantes.
¿Qué polimerasa produce el precursor de los rRNA 18S y 28S, y cuál transcribe el rRNA 5S?
Pol I produce el precursor de 18S y 28S; Pol III transcribe el rRNA 5S.
Durante el splicing, ¿qué segmentos se eliminan y cuáles se unen?
Se eliminan los intrones y se unen los exones.
Durante la elongación, ¿qué función cumplen los sitios A, P y E del ribosoma?
A: recibe el aminoacil-tRNA. P: sostiene el peptidil-tRNA. E: permite la salida del tRNA desacilado.
Un inductor inactiva a un represor y, como consecuencia, aumenta la transcripción. ¿Cómo se clasifica este control?
Regulación negativa inducible. Es negativa porque interviene un represor e inducible porque la señal aumenta la expresión.
En el caso FKBP5, ¿cuál es el elemento cis y cuál es el factor trans: GRE o GR? Justifica.
GRE es cis, porque forma parte del DNA regulador. GR es trans, porque es una proteína capaz de reconocer esas secuencias.
¿Qué función cumplen los factores generales de transcripción en el inicio de la transcripción por Pol II?
Participan en el ensamblaje del complejo de preiniciación, posicionando y reclutando a Pol II en el promotor.
¿Qué función cumple la secuencia AAUAAA del pre-mRNA? ¿Corresponde exactamente al sitio de corte?
Participa en el reconocimiento para el procesamiento del extremo 3′ y la poliadenilación. El corte ocurre aguas abajo de esta señal.
Usando la tabla del código genético, traduce 5′-AUG GCU AAA UGG CAU GGU UAG-3′. ¿Qué codón señala la terminación?
Met–Ala. UAG es el codón de terminación y no añade un aminoácido.
¿Qué función cumple el triptófano cuando se une al represor TrpR?
Actúa como correpresor: favorece que el represor se una al operador y disminuya la transcripción.
¿Qué diferencia existe entre las funciones de p300/CBP y SWI/SNF-BRG1 sobre la cromatina?
p300/CBP acetila histonas. SWI/SNF-BRG1 utiliza ATP para reorganizar los nucleosomas. Ambas funciones pueden favorecer el acceso al DNA.
Un gen carece de caja TATA. ¿Esto significa que no puede transcribirse? Justifica.
No. Existen promotores sin TATA que utilizan otros elementos, como Inr y DPE, para organizar el inicio.
Un intrón logra eliminarse del RNA en condiciones apropiadas sin proteínas catalíticas. ¿Qué propiedad demuestra ese RNA?
Tiene actividad catalítica: es una ribozima capaz de realizar autosplicing.
Un tRNA tiene el anticodón correcto, pero lleva un aminoácido equivocado. ¿El apareamiento correcto con el codón garantiza una proteína correcta? ¿En qué etapa ocurrió el error?
No. El error ocurrió durante la carga del tRNA por una aminoacil-tRNA sintetasa. El reconocimiento codón–anticodón no garantiza que el aminoácido transportado sea el correcto.
Si el inductor ya inactivó a LacI, ¿por qué la presencia de glucosa todavía puede limitar la expresión del operón lac?
La glucosa disminuye el AMPc, reduciendo la activación por CRP–AMPc. Retirar la represión de LacI no basta para alcanzar la máxima expresión.
En el fago lambda, ¿cómo se llama el estado en el que el genoma viral se mantiene integrado en el cromosoma bacteriano? ¿Cómo se denomina ese DNA viral integrado?
El estado es la lisogenia y el DNA viral integrado es el profago.
¿Cómo contribuye la fosforilación del dominio CTD de Pol II a coordinar la transcripción con el procesamiento del mRNA?
Genera sitios de unión para factores y enzimas de procesamiento, permitiendo que la síntesis y la maduración del RNA estén coordinadas.
Compara estos fragmentos de DNA codificante, ambos en sentido 5′→3′: normal: AAT ATC ATC TTT GGT GTT; mutante: AAT ATC ATT GGT GTT. ¿Qué aminoácido se pierde? ¿Se desplaza el marco de lectura? ¿ATC→ATT cambia el aminoácido?
Se pierde una fenilalanina. No se desplaza el marco porque se eliminaron tres nucleótidos. ATC y ATT codifican isoleucina, por lo que ese cambio conserva el aminoácido.
Escasea el tRNA cargado con triptófano. ¿Dónde se detiene el ribosoma en la región líder del operón trp, qué estructura del RNA se favorece y qué ocurre con la transcripción?
Se detiene en los codones de triptófano del péptido líder. Se favorece el apareamiento 2–3, que impide formar el terminador 3–4, permitiendo que continúe la transcripción.
Un fago replica su DNA normalmente, pero una mutación impide expresar los reguladores necesarios para activar sus genes tardíos. ¿Por qué podría acumular DNA viral sin producir partículas completas?
La replicación del genoma no basta. Los genes tardíos producen componentes necesarios para formar las partículas, y su expresión depende de los pasos anteriores de la cascada.