Introducción
¿Qué porcentaje de la materia muerta degradan los hongos en las selvas tropicales, según el texto?
Aproximadamente el 50%.
¿Cuál es el concepto más clásico y con disparidades para definir una especie fúngica?
El concepto morfológico o fenotípico.
Menciona dos limitaciones del enfoque fenotípico (morfológico) para identificar hongos.
1) No puede aplicarse a hongos que no crecen en cultivo. 2) Es subjetivo y depende de condiciones ambientales.
Según el texto, ¿en qué año Hawksworth estimó que había aproximadamente 1.5 millones de especies de hongos?
En 1991
¿Qué busca la taxonomía fúngica, según el texto?
Descubrir, describir y clasificar todas las especies de hongos, y proporcionar herramientas para su identificación.
Nombre dos de los ámbitos donde la correcta identificación de hongos es de gran importancia práctica, además del clínico humano.
Patología vegetal, biodeterioro, biotecnología o estudios medioambientales
Además del morfológico, nombre otros dos conceptos de especie de amplio uso en fitopatología y estudios ambientales.
El concepto politético, el ecológico y/o el biológico.
¿Qué tecnología permitió que el código de barras de ADN sea más rápido y económico?
La secuenciación de próxima generación (NGS, nanopore, Pac Bio).
Según Blackwell (2011), ¿entre qué números oscilaba la estimación de especies fúngicas gracias a los estudios de secuenciación de próxima generación?
Entre 3.5 y 5.1 millones.
¿Qué permite la biología molecular en la reorganización del árbol de la vida fúngico?
El estudio de secuencias de ADN o genomas completos para inferir relaciones filogenéticas y detectar especies crípticas.
De dos ejemplos de hongos patógenos se mencionan en el texto por haber "activado las alarmas" de los sistemas de salud mundial.
Candida auris y los mucorales (u hongos mucorales).
¿Por qué la diversidad de conceptos de especie genera "cierto caos", según el texto?
Porque todos se siguen empleando y no hay consenso sobre cuál usar, abandonar o seguir.
¿Qué son los "taxones oscuros" (dark taxa) en las bases de datos?
Especies hipotéticas sin revisión taxonómica formal, que podrían ser nuevas o ya conocidas pero sin secuencia ITS registrada.
Menciona dos razones por las que las estimaciones basadas en plantas huésped podrían subestimar el número real de especies de hongos.
1) Muchos hongos no tienen especificidad de huésped y son ubicuos. 2) No todos los hongos están asociados a plantas.
¿Por qué la organización del árbol de la vida de los hongos sigue siendo "muy cambiante" en sus ramas basales?
Por la naturaleza oculta y microscópica de muchos taxones, que tienen pocos representantes para generar ramas sólidas en las filogenias.
¿Cuál es el estimado anual de muertes humanas causadas por infecciones fúngicas que se cita en el texto?
Más de 1.6 millones de muertes.
A pesar del impacto de la filogenia genómica, ¿qué dos aspectos del reconocimiento de especies siguen siendo muy controversiales?
1) El reconocimiento de las especies en sí. 2) Sus relaciones filogenéticas (están sujetas a diferentes interpretaciones).
¿Qué problema presenta la variación intragenómica de las secuencias ITS?
Aunque útil para identificar muchas especies, esta variabilidad no está presente en todos los géneros (ej: Aspergillus, Penicillium), lo que limita su utilidad en esos casos. Otro aspecto es la asignación de valores de corte, es decir, qué tanto porcentaje de diferencia en la composición del ADN puede considerarse suficiente para separar dos especies
Según Hawksworth y Rossman, ¿dónde residen la mayoría de los hongos aún no conocidos?
En hábitats ya conocidos y explorados, pero que no es posible recuperar y estudiar con los métodos tradicionales empleados hasta ahora.
Además de Spatafora et al. (2017), ¿qué otra filogenia se utilizó para complementar la información de los clados en la revisión?
La filogenia propuesta por Naranjo-Ortiz y Gabaldón en 2019.
Según el texto, ¿Cuál es una de las paradojas o contradicciones presentadas respecto al conocimiento que tenemos de los hongos?
A pesar de que los humanos los conocen desde la prehistoria y de su enorme importancia, es relativamente poco lo que se sabe de ellos. Son muy importantes pero muy poco conocidos.
Según el texto, ¿qué dos factores han llevado a un aumento exponencial de "posibles especies nuevas" en las bases de datos, muchas de las cuales resultan ser sinónimos?
1) El creciente interés por conocer la biodiversidad. 2) El rápido desarrollo de las ciencias ómicas (que genera datos de genomas de lugares poco explorados).
Mencione dos ventajas de los genes codificantes de proteínas (como Tef1) sobre los genes ribosómicos (como ITS) para identificar especies.
1) Suelen presentarse como copia única en el genoma. 2) Son más fáciles de alinear por tener menos ambigüedad debido a restricciones de codones. 3) Evolucionan a un ritmo más rápido en sus regiones intrónicas.
¿Qué papel juegan los "taxones oscuros" en algunos linajes fúngicos basales según el texto?
En algunos casos, son los únicos miembros descritos para linajes importantes, principalmente de los grupos basales.
¿Cuántas secuencias de genomas completos de hongos estaban disponibles a mediados de mayo de 2023 según el texto, y en qué plataforma?
2.420 secuencias, disponibles en la plataforma MycoCosm