Epigenètica
Què és l'Epigenètica
Ciència que estudia canvis en el marcatge de l'ADN
Quines són les modificacions d'histones més estudiades en epigenètica?
La Metilació i l'Acetilació
Quin és el principal producte de la reacció de metilació de l'ADN? I descriu a què es refereix
la 5-metilcitocina, la incorporació d'un grup metil al C5 de la Citosina.
Què és un ARNnc i quin paper té?
És un ARN que no codifica per cap proteina però si que té un paper en la regulació de l'expressió dels gens
Què regula l'epigenètica?
l'accessibilitat a l'ADN, per tant tots els events que poden tenir-hi lloc (transcripció, replicació, reparació, etc)
A quins residus pot tenir lloc l'acetilació i la metilació de les histones i quants grups químics s'hi poden incorporar?
Acetilació: a les Lys, 1 -Acetil
Metilació: a les Lys (mono, di i tri-metil) i Arg (mono i di-metil)
Què és una illa CpG?
Regió de més de 200pb amb un alt percentatge de GC (>50%) i que es troben principalment en les regions promootores del gens
Com es classifiquen els ARNnc?
Segons la seva longitud en:
- ARN de cadena curta
- ARN de cadena llarga
Per què pot estar influenciada l'epigenètica?
Per l'ambient: Nutrició, exercici físic, contaminació, fàrmacs, etc.
A les zones d'eucromatina quines marques d'histones podràs trobar?
- Hiperacetilació de les histones
- Metilacions associades a activació: H3K4, H3K36 i H3K79
A quines regions del nostre genoma s'ha descrit que es poden trobar metilacions i amb què es troben relacionades?
- Promotors: activació o no de la transcripció
- Cos del gen: Splicing i inici de la transcripció
- Regions estructurals: Estabilitat genòmica
Què és el Xist i en quin mecanisme intervé?
El Xist és un ARNnc de cadena llarga que té un paper important en la inactivació del cromosoma X.
Explica què és el procés de clonació i per què els animals obtinguts són menys sans.
- Obtenció d'un organisme a partir de l'ADN d'una cèl·lula d'un organisme adult diferenciada.
- Són menys sans per què es creu que durant el procés no s'han eliminat totes les marques epigenètiques que hi havia a l'ADN de la cèl·lula diferenciada.
Tenim un gen que no s'expressa i voldriem aumentar la seva expressió. Què faries?
- Nutrient que activa a les HDAC
- Nutrient que inhibeix a les HAT
- Nutrient que inhibeix a les HDAC
- Nutrient que activa a les HAT
Nutrient que inhibeix a les HDAC o activa a les HAT
El gen de la rodopsina s'expressa només en cèl·lules dels bastons de la retina. Com es troba el promotor d'aquest gen, referent a la metilació del ADN, en aquestes cèl·lules?
En les cèl·les dels bastons aquest gen s'expressa i per tant presenta una hipometilació d'ADN en el seu promotor
Si tenim un miARN que inactiva el gen "Nutri". Com actuarà?
L'ARNnc, un cop hagi passat el procés de maduració, s'incorporarà al complexe RISC i aquest guiarà el complexe al ARNm del gen "Nutri", inhibint la trasncripció ja sigui per degradació del l'ARNm o per inhibició de la traducció.
Com podries regular la epigenètica a través de la Nutrició?
- Regulant la disponibilitat de Substrat de la reacció (grups químics que s'incorporen)
- Regulant la disponibilitat i activitat dels enzims que participen en la reacció epigenètica
Quines marques d'histones presentarà el gen de la insulina en una cèl.lula dendrítica?
Marques associades a repressió: hipoacetilació de les histones i metilació H3K9, H3K27 i H4K20
El càncer és una malaltia d'envelliment que s'associa a inestabilitat del genòma. Quin tipus de nutrient podries recomanar per tal de disminuir aquesta inestabilitat genòmica i per què?
Els nutrients donadors de grup metil estariem contribuint a la metilació de les regions estrucutrals del genoma i per tant estariem promovent l'estabilitat genòmica.
Tenim un factor de transcripció amb un domini "Chromo-domain" que quan es troba unit al promotor activa la transcripció. S'expressarà el gen si tenim una acetilació a la H4K5 que inhibeix la metilació de la H4R3? (reduim-ho tot a aquestes dues modificacions d'histones)
No, el gen no s'expressarà ja que el factor de transcripció no es pot unir a la H4R3, ja que no es troba metilada.